Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clip1Q922J3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip1Q922J3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms