Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Setd3Q91WC0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms