Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM5

Myocd, Myocardin, mousemouse

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Length 935 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyocdQ8VIM5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MyocdQ8VIM5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MyocdQ8VIM5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms