Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1aQ8VDS4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rprd1aQ8VDS4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rprd1aQ8VDS4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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