Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Q8VDP2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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