Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim29Q8R2Q0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms