Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Hoxc12Q8K5B8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Hoxc12Q8K5B8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Hoxc12Q8K5B8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hoxc12Q8K5B8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxc12Q8K5B8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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