Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MyripQ8K3I4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms