Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms