Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trim68Q8K243 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim68Q8K243 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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