Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Nek9Q8K1R7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nek9Q8K1R7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek9Q8K1R7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms