Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS7

Hmgcll1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgcll1Q8JZS7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hmgcll1Q8JZS7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hmgcll1Q8JZS7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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