Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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LgsnQ8CIX8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LgsnQ8CIX8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms