Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hpf1Q8CFE2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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