Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Snx30Q8CE50 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx30Q8CE50 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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