Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc73Q8CDM4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc73Q8CDM4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc73Q8CDM4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc73Q8CDM4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccdc73Q8CDM4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc73Q8CDM4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms