Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc87Q8CDL9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms