Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ttc27Q8CD92 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc27Q8CD92 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms