Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E4f1Q8CCE9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E4f1Q8CCE9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms