Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppfibp1Q8C8U0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms