Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933409G03RikQ8C5U0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933409G03RikQ8C5U0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms