Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnot2Q8C5L3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot2Q8C5L3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms