Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nek11Q8C0Q4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nek11Q8C0Q4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.5 ms