Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trerf1Q8BXJ2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trerf1Q8BXJ2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trerf1Q8BXJ2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trerf1Q8BXJ2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trerf1Q8BXJ2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trerf1Q8BXJ2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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