Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ube3dQ8BX13 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ube3dQ8BX13 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms