Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Usp38Q8BW70 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp38Q8BW70 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Usp38Q8BW70 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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