Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx17Q8BVL3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx17Q8BVL3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms