Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms