Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3Q8BRE0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3Q8BRE0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms