Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc172Q810N9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms