Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ChfrQ810L3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms