Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5bQ80Y84 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms