Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc29Q80VM3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ttc29Q80VM3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc29Q80VM3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms