Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc155Q80VJ8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms