Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rexo1Q7TT28 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rexo1Q7TT28 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rexo1Q7TT28 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rexo1Q7TT28 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rexo1Q7TT28 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rexo1Q7TT28 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rexo1Q7TT28 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rexo1Q7TT28 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rexo1Q7TT28 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rexo1Q7TT28 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rexo1Q7TT28 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rexo1Q7TT28 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rexo1Q7TT28 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rexo1Q7TT28 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo1Q7TT28 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms