Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LnpkQ7TQ95 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LnpkQ7TQ95 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms