Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trak1Q6PD31 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trak1Q6PD31 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms