Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Usp49Q6P9L4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms