Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Senp6Q6P7W0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Senp6Q6P7W0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms