Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7F1

Mpp4, MAGUK p55 subfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpp4Q6P7F1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpp4Q6P7F1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpp4Q6P7F1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpp4Q6P7F1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpp4Q6P7F1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mpp4Q6P7F1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mpp4Q6P7F1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms