Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smchd1Q6P5D8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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