Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm4Q6IRU2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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