Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg9bQ6EBV9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms