Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ric1Q69ZJ7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ric1Q69ZJ7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms