Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcg1Q64343 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms