Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Surf4Q64310 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms