Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col4a5Q63ZW6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a5Q63ZW6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms