Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift52Q62559 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms