Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufa4Q62425 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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