Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ss18Q62280 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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